El equipo mejora en la Bundesliga 2011-12 pero solo le da para ser subcampeón tras el Borussia Dortmund. De esta manera, el conjunto muniqués se clasificaba para jugar la final de la Liga de Campeones 2011-12 que se diputaba su estadio, el Allianz Arena ante el Chelsea. Finalmente el Bayern acabó nuevamente la temporada sin títulos, equipacion liverpool al perder las finales de Copa -5:2 ante el Borussia Dortmund- y Liga de Campeones -por penaltis-.